การเดินทางไปเกาะฮอกไกโด เครื่องบิน ไม่มีเที่ยวบินตรงจากประเทศไทยไปยังเกาะฮอกไกโดโดยตรง แต่มีเที่ยวบินภายในประเทศญี่ปุ่นบินสู่เมืองต่าง ๆ บนเกาะฮอกไกโดหลาย ๆ สนามบินหลักทั้งที่โตเกียว (Haneda,Narita) นาโกย่า (Chubu) โอซาก้า (Kansai) และฟุกุโอกะ ถ้าไม่แวะเที่ยวเมืองเหล่านี้ก่อน ก็สามารถต่อเที่ยวบินสู่ฮอกไกโดได้เลย โดยสายการบินที่บินในเส้นทางเหล่านี้ มีทั้งสายการบินออลนิปปอนแอร์เวย์ (ANA) เจแปนแอร์ไลน์ (JAL) แอร์โด (Air Do) สกายมาร์ค (Skymark) เป็นต้น หรือไม่ก็บินไปกับสายการบินต่างชาติที่มีเที่ยวบินไปยังเกาะฮอกไกโด อย่างเช่น สายการบินโคเรียนแอร์ ของเกาหลีใต้ สายการบินอีวาแอร์ของไต้หวัน หรือคาเธ่ย์แปซิฟิคจากฮ่องกง จากโตเกียวถึงซัปโปโร ใช้เวลาบินประมาณ 90 นาที ค่าโดยสารเที่ยวเดียวอยู่ระหว่าง 16,000-30,000 เยน (Skymark กับ Air Doราคาจะถูกกว่าสายการบิน ANA และ JAL) เรือ มีเรือเฟอร์รี่ออกจากท่าเรือในเมืองต่าง ๆ บนเกาะฮอนชู อาทิ อาโอโมริ ฮาชิโนเฮะ เซ็นได นิอิงาตะ มายังท่าเรือในเมืองบนเกาะฮอกไกโดที่ฮาโกดาเตะ โมมาโคไม โอตารุ มูโมรัน เป็นต้น แต่การเดินทางด้วยเรือเฟอร์รี่เป็นการเดินทางที่ใช้เวลาค่อนข้างนาน รถไฟเจอาร์ ถ้ามีแผนการเดินทางมากกว่า 7 วันขึ้นไป แนะนำให้ซื้อบัตรโดยสาร JR Rail Pass สามารถใช้เดินทางได้ตั้งแต่ออกจากสนามบิน นั่งรถไฟชินคันเซ็น รถไฟสายด่วน (Limited Express) ข้ามเกาะฮอนชูเข้าไปยังฮอกไกโด แล้วนั่งรถไฟเจอาร์ฮอกไกโดได้ทุกสายไม่จำกัดจำนวนเที่ยวและระยะทาง หรือถ้านั่งเครื่องบินไปลงที่ฮอกไกโดโดยตรง ก็สามารถซื้อตั๋วรถไฟเหมาจ่าย JR Hokkaido Pass เดินทางโดยรถไฟเจอาร์ฮอกไกโดได้อย่างไม่จำกัดเช่นกัน